2008年11月3日，由中国气象局科技发展司负责组织、由国家气象中心李泽椿院士等专家和领导共同组成的评估组来到台风所，就近三年来全所的工作情况进行了综合评估和考察。上海市气象局汤绪局长、徐惠文巡视员及有关职能部门领导全程参加了评估活动，台风所全体领导班子成员及部分科研人员代表台风所参加了评估活动。李泽椿院士作为评估专家组组长主持了评估会。

评估会上，中国气象局科技发展司的领导首先介绍了本次评估的主要目的，指出本次评估旨在考察研究所近三年来的发展情况、取得的成绩及存在的问题和困难，以便更好地促进专业所的发展，突出专业优势，围绕地方经济和气象业务需求开展研究工作，并指出本次评估的内容主要包括院所科研能力水平、为气象业务发展提供科技支撑、人才队伍建设情况等方面，评估方式采取自评、座谈、现场考察及问卷调查等相结合的综合方式进行。

评估期间，台风所雷小途所长代表全所职工就2005－2007年三年期间全所各项重点工作情况进行了汇报，余晖和李永平研究员分别就台风所特色科研工作做了专题学术报告。评估组在听取工作汇报和专题学术报告的基础上，随机提名与部分科研人员进行了个别座谈。下午，评估专家组现场考察了台风所的移动雷达及追风观测等设备，参观了台风所办公区域和网络中心等工作场所。

经过评估汇报和现场考察，评估专家组总体认为，台风所的目标定位准确，学科设置方向明确，领导工作思路清晰，近年内的工作成绩较为突出，对业务提供良好的科技支撑，促进了人才队伍的建设和发展，对我国台风科学研究水平的提高起到了积极的推动作用。评估结束之际，代表上海市气象局，汤绪局长发表了讲话并对中国气象局专家组的一行指导表示了衷心感谢，他殷切地希望台风所的领导和专家能够相互共勉，立足国家需求的出发点，加快我国台风研究的步伐，为国家防台减灾工作做出更大贡献。